Обучение нацелено на подготовку специалистов по организации экологического контроля и промышленной безопасности, в том числе на:

• обеспечение соблюдения природоохранного законодательства;
• составление планов по охране окружающей среды, контроль за их выполнением;
• разработку мер по предотвращению загрязнения окружающей среды;
• составление и согласование экологической отчетности;
• расчет платы за загрязнение окружающей среды;
• взаимодействие с контролирующими государственными органами.

В рамках магистерской программы изучаются следующие дисциплины:

• Техника защиты окружающей среды в таможенном деле
• Экологическое право
• Национальная и экологическая безопасность
• Управление охраной окружающей среды
• Основы конструирования и проектирования экологических приборов
• Современные приборы экологического контроля в таможенных органах РФ
• Оценка воздействия на окружающую среду (ВОС) и экологическая экспертиза в таможенном деле
• Таможенное оформление и таможенный контроль особо опасных и ядовитых грузов
• Обеспечение таможенного контроля в вопросах техносферной безопасности
• Трансграничное сотрудничество в вопросах защиты окружающей среды в чрезвычайных ситуациях

Выпускники университета осуществляют профессиональную деятельность в области экологической безопасности в таможенной службе, на промышленных предприятиях, в государственных организациях, в транспортных компаниях: в экологических управлениях, в управлениях охраны труда, техники безопасности и экологии, инженерных подразделениях, отделах контроля и службах безопасности.